scRNA-seq初挑戦、Chromiumで装置以外に詰まるポイントは？

Question

初めてのシングルセルでChromium Xを検討中です。装置より細胞調製やダブレット率、解析で失敗しがちと聞きました。最初にハマりやすい所と対策を教えてほしいです。

たく · Accepted Answer

装置はChromium Xで問題ないですが、勝負は細胞懸濁のクオリティです。生存率とダブレットがすべてで、ローディング細胞数を欲張らないのがコツ。解析（Cell Ranger以降）の方が時間を食うので、最初から解析担当とペアで始めるのをおすすめします。